Как только во время работы изменится загрузочный сектор основного раздела Linux, вам придется повторить операцию с копированием файла bootsect.lnx в C:\BOOTSECT.LNX. Такое может произойти, например, после того, как вы обновите версию вашей системы или переустановите lilo. Понятно, что подобная комбинация систем совсем не предназначена для отладки и тестирования экспериментальных версий ядер Linux.